主要職能：承擔湛江片區(qū)的稽核查業(yè)務；承擔湛江片區(qū)（廉江海關、徐聞海關除外）的加貿及保稅管理；承擔湛江片區(qū)（廉江海關、徐聞海關除外）的企業(yè)管理業(yè)務；承擔湛江片區(qū)（廉江海關除外）的原產(chǎn)地業(yè)務；承擔湛江片區(qū)（廉江海關、東海島海關除外）的進口目的地檢驗、出口產(chǎn)地/組貨地檢驗檢疫等屬地管理業(yè)務；承擔湛江片區(qū)（廉江海關、海東新區(qū)海關除外）的減免稅審批；承擔湛江片區(qū)（霞山海關、徐聞海關、廉江海關除外）的保稅倉庫、出口監(jiān)管倉庫監(jiān)管業(yè)務；承擔湛江綜合保稅區(qū)和湛江保稅物流中心（B型）業(yè)務；承擔湛江關區(qū)快件、電商集中審單業(yè)務。

機構設置：辦公室（黨委辦公室）、人事政工科（黨委組織宣傳部）、財務科、保稅監(jiān)管科、綜合業(yè)務科、稽核查科、審核監(jiān)督科、企業(yè)管理科、查檢一科、查檢二科、非貿審單科、綜保區(qū)監(jiān)管科。